在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：
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通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。
常见参数:
切记：用less命令，按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前：
排列后：
解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之，uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符
补充小知识 ：
清屏 ：control L
查看历史（输入过的）命令 ：history
先按ESC进入Command模式，然后输入“：wq”，回车就可以保存并退出了。
vi的其他保存/退出命令：
:w 保存；
:w filename 另存为filename；
:wq! 保存并强制退出；
:wq! filename 注：以filename为文件名保存后强制退出；
:q! 强制退出；
:x 保存并退出（仅当文件有变化时保存）
扩展资料：
vi有三种工作模式：命令模式、文本编辑模式和最后行模式。不同工作模式下的操作方法有所不同。
1、命令行模式
该模式是进入vi编辑器后的默认模式。任何时候，不管用户处于何种模式，按下Esc键即可进入命令模式。
在命令模式下，用户可以输入vi命令，用于管理自己的文档。此时从键盘上输入的任何字符都被当做编辑命令来解释。若输入的字符是合法的vi命令，则vi在接受用户命令之后完成相应的动作。但需注意的是，所输入的命令并不回显在屏幕上。若输入的字符不是vi的合法命令，vi 会响铃报警。
2、文本输入模式
在命令模式下输入插入命令i、附加命令a、打开命令o、修改命令c、取代命令r或替换命令s都可以进入文本输入模式。
在该模式下，用户输入的任何字符都被vi当做文件内容保存起来，并将其显示在屏幕上。在文本输入过程中，若想回到命令模式下，按下Esc键即可。
3、末行模式
末行模式也称 ex 转义模式。在命令模式下，用户按:键即可进入末行模式下，此时vi会在显示窗口的最后一行（通常也是屏幕的最后一行）显示一个:作为末行模式的说明符，等待用户输入命令。多数文件管理命令都是在此模式下执行的（如把编辑缓冲区的内容写到文件中等）。
末行命令执行完后，vi 自动回到命令模式。
参考资料：百度百科-vi
1、linux保存并退出命令。
2、linux命令行保存并退出。
3、linux中保存退出和不保存退出的命令。
4、linux退出命令。
1."linux保存并退出命令，为您提供linux保存并退出命令图文信息，先按键盘上面的ESC按键，接着输入冒号，然后再输入wq并回车即可保存退出，另外只输入冒号和q为不保存退出，而输入！q为强制退出，！wq为强制保存退出。
1.如图，vi 文件名，接着按回车即可打开对应的文件，如果没有对应的文件，那么vi命令就会自动创建一个新的。
2.如图，vi打开文件后是命令模式状态，要用i或者a命令才可进入可编辑的状态哟。这里我就按a进入了编辑模式了哦。
3.如图，在编辑模式的情况下敲完内容，这个时候就应该保存文件了。保存文件要按esc，这样就会退回vi的命令模式喔。
4.按完esc后输入冒号（英文的），然后就转换到了末行模式了，末行模式决定是否保存文件。
5.如图所示，末行模式下可以按x来保存，x命令可以保存编辑好的文件哟。
6.也可以用到wq来保存，如果是q!则不保存哦，这点要自己谨记在心，这里我就保存一下vi编写的文件。
7.然后查看，查看用到了cat 文件名哦。
8.如图所示，vi编写的内容可以看到，这表明保存成功。
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