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circad数据库有什么用

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环状RNA具有重要的转录调控功能,越来越多的研究表明,环状RNA在许多疾病的发生与发展中扮演重要角色,circad是一个疾病相关的环状RNA数据库,网址如下

http://clingen.igib.res.in/circad/

该数据库中,共收录了122种疾病和相关的1000个环状RNA,包含了618个基因,是目前最为全面的疾病相关的环状RNA数据库。

对于每种疾病,提供了国际疾病分类系统ICD-10对应的编码,来唯一标识,同时还提供了对应的文献,方便研究者查阅和参考。

官网提供了以下多种检索方式

  1. circRNA Name

  2. Gene

  3. Locus

  4. Organism

  5. Disease

  6. ICD-10

以乳腺癌为例,对应的ICD-10的编码为C50,检索结果如下所示

circad数据库有什么用

第一列是环状RNA的名字,第二列是别名,第三列是环状RNA来源基因的名字,第四列为环状RNA的基因组位置,第五列为物种,第六列为疾病对应的ICD-10编码,第七列为疾病的名称。

点击环状RNA的名字,可以查看详细信息,结果示意如下

circad数据库有什么用

会给出对应的检测方法,参考文献,以及在患病者中的表达趋势。

目前数据库对应的文献还没有正式发表,发表之后这数据库就会公开下载链接。

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